20/02/2021

GTF,全称为:gene transfer format,主要用于对基因进行注释

GFF,全称为:general feature format,主要用于对基因组进行注释


    GTF文件由9列数据组成,内容如下:

    chr22  TeleGene enhancer  10000000  10001000  500 +  .  touch1

    注意:1.根据所使用的软件的不同,feature types是必须注明的。

                2.第9列必须以gene_id以及transcript_id开头

                3.GTF文件的第9列同GFF文件不同,虽然同样是标签与值配对的情况,但标签与值之间以空格分开,且每个特征之后都要有分号;(包括最后一个特征)












 

    GFF文件也由9列数据组成

        注意:1.第九列的属性是以标签=的形式表明的,之间用分隔


    参考自:https://www.jianshu.com/p/48b5a0972301

闲言碎语

静坐品茗