20/02/2021
GTF,全称为:gene transfer format,主要用于对基因进行注释
GFF,全称为:general feature format,主要用于对基因组进行注释
GTF文件由9列数据组成,内容如下:
chr22 TeleGene enhancer 10000000 10001000 500 + . touch1
注意:1.根据所使用的软件的不同,feature types是必须注明的。
2.第9列必须以gene_id以及transcript_id开头
3.GTF文件的第9列同GFF文件不同,虽然同样是标签与值配对的情况,但标签与值之间以空格分开,且每个特征之后都要有分号;(包括最后一个特征)
GFF文件也由9列数据组成
注意:1.第九列的属性是以 ‘标签=值’ 的形式表明的,之间用‘;’分隔